Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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