Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMSS1Q9BQ75 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms