Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms