Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3Q99687 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3Q99687 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms