Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms