Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms