Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms