Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC136Q96JN2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms