Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BORCS6Q96GS4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms