Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELP4Q96EB1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms