Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms