Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C12orf43Q96C57 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms