Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPTQ96BT3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPTQ96BT3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms