Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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TRIM63Q969Q1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM63Q969Q1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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TRIM63Q969Q1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM63Q969Q1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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