Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP13Q92995 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP13Q92995 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP13Q92995 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP13Q92995 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP13Q92995 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP13Q92995 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP13Q92995 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP13Q92995 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP13Q92995 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP13Q92995 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP13Q92995 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP13Q92995 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP13Q92995 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP13Q92995 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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