Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRG4Q92954 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms