Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms