Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms