Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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