Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUSD1Q6UWL2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms