Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD2Q6P5Q4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD2Q6P5Q4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms