Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C3orf33Q6P1S2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms