Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD54Q6NXT1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms