Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS3Q68E01 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms