Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF123Q5XPI4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF123Q5XPI4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms