Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms