Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP170Q5SW79 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP170Q5SW79 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms