Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf38Q5JPI3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms