Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms