Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL12Q53G59 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms