Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms