Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms