Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC57Q2TAC2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms