Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms