Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSG1Q2KHT4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSG1Q2KHT4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms