Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIST3H3Q16695 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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