Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC096759.2-202ENST00000515230 777 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 HERC2P4-202ENST00000564145 683 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD1Q16676 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD1Q16676 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
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