Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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