Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PUM3Q15397 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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