Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF4Q15306 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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