Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMCO1Q147U7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMCO1Q147U7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMCO1Q147U7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMCO1Q147U7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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