Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms