Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EFR3AQ14156 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EFR3AQ14156 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms