Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1CQ13936 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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