Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TOP3AQ13472 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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