Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXE3Q13461 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXE3Q13461 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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FOXE3Q13461 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXE3Q13461 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXE3Q13461 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXE3Q13461 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXE3Q13461 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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FOXE3Q13461 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FOXE3Q13461 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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