Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATMQ13315 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATMQ13315 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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