Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIGQ13278 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIGQ13278 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RIGQ13278 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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