Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCP2Q13094 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCP2Q13094 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms