Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXF1Q12946 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXF1Q12946 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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